各学院（部）：激情文学

　　为深远实施立异开动发展战术，加速成立具有人人影响力的科技立异中心，凭证《上海市成立具有人人影响力的科技立异中心“十四五”筹画》《上海市计较生物学立异发展步履盘算（2023-2025年）》，上海市科学本事委员会发布2024年度“科技立异步履盘算”计较生物学领域神色讲演指南。

一、搜集范围

　　专题一、生物大数据共性算法

　　标的1：个体化基因抒发调控元件功能默契算法

　　研究接洽：诱惑默契基因抒发和调控元件活性的算法，达成等位基因特异性调控元件的功能臆测，性能比拟海外主流算法提高10%以上。

　　研究骨子：诱惑基于个体基因组的基因抒发及调控元件活性定量默契算法，揭示东谈主类基因组中等位基因抒发偏执调控的细胞和组织特异性机制；诱惑精确臆测跨细胞和组织类型的等位基因特异性调控元件的计较模子，默契在神经系统发育和复杂疾病发生发展经由中的作用机制。

　　本质期限：2024年12月1日至2027年11月30日。

　　经费额度：非定额资助，拟支捏不起初1个神色，每项资助额度不起初200万元。

　　标的2：细胞微环境调控集结的智能化默契算法

　　研究接洽：诱惑默契细胞微环境调控集结的智能化分析算法，默契细胞微环境调控集结对细胞运谈决定和表不雅遗传重塑的影响机制，性能比拟海外主流算法提高10%以上。

　　研究骨子：诱惑默契细胞微环境调控集结的智能化分析算法，精确默契胚胎发育、癌症发生等经由中细胞微环境多模态生物学特征间的相互关系，包括但不限于功能细胞组分、表不雅遗传景不雅、生物分子流等特征默契，并恣意出与细胞运谈决定和表不雅遗传重塑密切关联的要紧细胞微环境特征。

　　本质期限：2024年12月1日至2027年11月30日。

　　经费额度：非定额资助，拟支捏不起初1个神色，每项资助额度不起初200万元。

　　标的3：复杂表型的遗传与环境要素默契算法

　　研究接洽：诱惑外部骄横与里面多模态表型之间的默契算法，进展转折遗传和环境要素对复杂表型的影响机制，臆测性能比拟海外主流算法提高10%以上。

　　研究骨子：整合基因组、环境骄横组、微不雅表型和宏不雅复杂表型等数据，设置集基因定位默契、因果关系推断等功能的集结模子；诱惑影响东谈主体细胞、分子等表型的遗传和环境要素默契算法，系统默契外部骄横与里面多模态表型之间的相互作用。

　　本质期限：2024年12月1日至2027年11月30日。

　　经费额度：非定额资助，拟支捏不起初1个神色，每项资助额度不起初200万元。

　　标的4：生物神经元信息整合数学表面

　　研究接洽：发展生物神经元整合信息的数学表面，设置新式类脑集结模子，达成1个量级以上参数目的优化，精度比拟海外主流算法提高5%以上。

　　研究骨子：诱惑偶然默契真确生物神经元职责机制的数学表面分析框架，设置具有神经元树突计较功能的新式脉冲神经元模子；发展神经元异构联接下的集结能源学编码数学表面，诱惑新式类脑神经集结以及能源学演化算法，并在经典图像（动态）识别、归附及分类等基准问题上进行考证。

　　本质期限：2024年12月1日至2027年11月30日。

　　经费额度：非定额资助，拟支捏不起初1个神色，每项资助额度不起初200万元。

　　专题二、卵白质与核酸遐想纠正

　　标的1：卵白质动态结构臆测与遐想

　　研究接洽：诱惑低分辨率数据计较步履，提高卵白质分子能源学模拟限度，达成自然无规卵白的动态构象臆测并诱惑卵白质的结构遐想。

　　研究骨子：基于晶体衍射或冷冻电镜等实验数据，诱惑提高结构默契分辨率的计较步履，从低分辨率实验数据分析索要大分子结构动态分散信息；发展生物大分子结构臆测的柔性建模算法，设置卵白质分子能源学模子；达成对大界限自然无规卵白动态构象的系统臆测，并诱惑卵白质的结构遐想。

　　本质期限：2024年12月1日至2027年11月30日。

　　经费额度：非定额资助，拟支捏不起初1个神色，每项资助额度不起初200万元。

　　标的2：核酸结构臆测和遐想优化

　　研究接洽：设置自主可控的核酸大言语模子，提高核酸结构与功能的臆测精度，核酸遐想优化性能比拟海外同期最高水平提高5%以上。

　　研究骨子：基于遍及核酸序列考试数据，诱惑自主可控的通用核酸序列言语模子，精确臆测核酸结构、甲基化修饰、可变剪切等事件，达成RNA病毒演化趋势的臆测，以及更高卵白抒发限度核酸序列的遐想优化。

　　本质期限：2024年12月1日至2027年11月30日。

　　经费额度：非定额资助，拟支捏不起初1个神色，每项资助额度不起初200万元。

　　专题三、AI药物遐想

　　标的1：疾病靶标可搅扰变构位点的识别步履诱惑与考证

　　研究接洽：诱惑可搅扰变构位点识别的新步履，构建达到海外先进水平的变构药物遐想系统，发现2个以上候选小分子药物，取得动物水平灵验性评价回报。

　　研究骨子：构建标准化变构位点数据集，接管并优化增强采样、特征生成、功能评价等智能算法，识别靶标中可得志疾病搅扰需求的变构新位点；设置变构药物遐想系统，筛选肿瘤等疾病的候选小分子药物并进行灵验性考证。

　　本质期限：2024年12月1日至2027年11月30日。

　　经费额度：非定额资助，拟支捏不起初1个神色，每项资助额度不起初300万元。

讲演主体要求：本市企业。

　　标的2：药物分子精确生成步履诱惑与考证

　　研究接洽：诱惑分子三维构象生成模子和分子原位生成步履，完成候选药物分子生成和考证，发现2个以上候选小分子药物，取得动物水平灵验性评价回报。

　　研究骨子：基于分子图数据增强本事和生成式算法，设置精确的分子三维构象生成模子，诱惑片断分子表征步履和基于靶标结构的原位生成步履，达成多元分子的重更生成和结构优化，取得高成药性候选分子并进行灵验性考证。

　　本质期限：2024年12月1日至2027年11月30日。

　　经费额度：非定额资助，拟支捏不起初1个神色，每项资助额度不起初300万元。

讲演主体要求：本市企业。

　　标的3：抗体药物遐想步履诱惑与考证

　　研究接洽：诱惑抗体药物的凭空筛选与遐想优化本事，达成抗体药物的快速高效发现，发现2个以上候选抗体药物，取得动物水平灵验性评价回报。

　　研究骨子：默契构象表位与抗体特异识别机制，设置生成式东谈主工智能模子，达成大界限抗体序列库高效凭空筛选；诱惑抗体药物的表位组合、免疫原性优化和毒反作用纠正等成药性本事，达成肿瘤、本人免疫等高发疾病抗体药物的筛选和遐想优化并进行灵验性考证。

　　本质期限：2024年12月1日至2027年11月30日。

　　经费额度：非定额资助，拟支捏不起初1个神色，每项资助额度不起初300万元。

讲演主体要求：本市企业。

　　标的4：类抗菌肽药物遐想步履诱惑与考证

　　研究接洽：设置类抗菌肽药物的抗菌活性臆测与结构智能遐想模子，诱惑2个以上高效耐药细菌或真菌类的类抗菌肽，取得动物水平灵验性评价回报。

　　研究骨子：诱惑大分子通用表征本事，设置类抗菌肽药物的活性臆测模子，达成构效关系的深远分析与精确臆测；诱惑跨骨架的类抗菌肽生成模子，遐想具有高效广谱抗菌活性的类抗菌肽并进行灵验性考证。

　　本质期限：2024年12月1日至2027年11月30日。

　　经费额度：非定额资助，拟支捏不起初1个神色，每项资助额度不起初300万元。

讲演主体要求：本市企业。

　　专题四、计较生物学在临床要紧疾病精确诊疗中的运用

　　标的1：疾病多组学测量数据的标准化处理

　　研究接洽：诱惑批次效应校正等组学数据处理的标准化本事，达成肿瘤等要紧疾病亚型的精确识别并完成性能考证。

　　研究骨子：诱惑标准化的数据整合、批次效应校正等本事，提高疾病部队多组学数据的质料；基于疾病多组学数据诱惑疾病的精确分型算法，识别肿瘤等要紧疾病的分子亚型并达成临床运用。

　　本质期限：2024年12月1日至2027年11月30日。

　　经费额度：非定额资助，拟支捏不起初1个神色，每项资助额度不起初300万元。

　　标的2：基于医疗多模态数据的常识推理

　　研究接洽：设置袒护全科中枢常识的医疗大模子，基于多种要紧疾病多模态数据集的考试学习，达成2种以上要紧疾病的协同诊断。

　　研究骨子：接管常识推理、统计分析、能源学建模等步履，交融多维组学、临床信息等多模态医疗数据，构建医疗大模子，并在2种以上要紧疾病的协同诊断和个体化精确休养等运用场景进交运用考证。

　　本质期限：2024年12月1日至2027年11月30日。

　　经费额度：非定额资助，拟支捏不起初1个神色，每项资助额度不起初300万元。

　　标的3：基于泛基因组学的肿瘤精确诊疗分析

　　研究接洽：诱惑肿瘤泛基因组构建本事，设置我国高发癌症的泛基因组，精确识别癌症诊疗标识物，识别准确性高于现存通用检测步履。

　　研究骨子：诱惑具有致密可膨胀性的肿瘤泛基因组构建本事，设置我国高发癌症的泛基因组；基于泛基因组诱惑癌症变异识别、分析及图形化展示系统，精确发现我国高发癌症的临床诊疗标识物。

　　本质期限：2024年12月1日至2027年11月30日。

　　经费额度：非定额资助，拟支捏不起初1个神色，每项资助额度不起初300万元。

　　标的4：重性精神疾病精确早期预警

　　研究接洽：诱惑重性精神疾病多组学数据与环境要旧友互作用的分析系统，达成对精神分裂症等重性精神疾病患者的早期预警。

　　研究骨子：基于重性精神疾病大样本多组学资源平台，诱惑基因组结构变异、转录组剪切变异、表不雅修饰变异等数据分析算法，结合全基因组关联本事及回归性环境要素数据，设置精神分裂症等重性精神疾病早期预警系统，为临床早期搅扰提供赞成。

　　本质期限：2024年12月1日至2027年11月30日。

　　经费额度：非定额资助，拟支捏不起初1个神色，每项资助额度不起初300万元。

　二、讲演要求

　　除得志前述相应条目外，还须罢免以下要求：

1.神色讲演单元应当是注册在本市的法东谈主或造孽东谈主组织，具有组织神色实施的相应才智。

2.对于央求东谈主在以往市级财政资金或其他机构（如科技部、国度当然科学基金等）资助神色基础上建议的新神色，应明确论述二者的异同、秉承与发展关系。

3.通盘讲演单元和神色参与东谈主应顺从科研诚信护士要求，神色追究东谈主承诺诺所提交材料真确性，讲演单元应当对央求东谈主的央求阅历追究，并对央求材料的真确性和好意思满性进行审核，不得提交有涉密骨子的神色央求。

4.讲演神色若建议秘籍众人央求的，须在提交神色可行性决策的同期，上传由讲演单元出具公函建议秘籍众人名单与事理。

5.通盘讲演单元和神色参与东谈主应顺从科技伦理准则。拟开展的科技步履应进行科技伦理风险评估，波及科技部《科技伦理审查宗旨（试行）》（国科发监〔2023〕167号）第二条所列范围科技步履的，应按要求进行科技伦理审查并提供相应的科技伦理审查批准材料。

6.已动作神色追究东谈主承担市科委科技盘算在研神色2项及以上者，不得动作神色追究东谈主讲演。

7.神色经费预算编制应当真确、合理，合乎市科委科技盘算神色经费护士的相干要求。

8.每位神色追究东谈主讲演神色不起初1项。

9.饱读动神色产生的代码提交到GitHub等学术社分离享。

　　三、讲演款式

1.神色讲演接管网上讲演款式，无需送交纸质材料。央求东谈主通过“中国上海”流派网站（）--政务管事--点击“上海市财政科技进入信息护士平台”进入讲演页面，或者胜利通过域名https://czkj.sheic.org.cn/进入讲演页面：

　　【初度填写】使用“一网通办”登录（如尚未注册账号，请先转入“一网通办”注册账号页面完成注册），进入讲演指南页面，点击相应的指南专题，进行神色讲演；

　　【链接填写】使用“一网通办”登录后，链接该神色的填报。

　　相干操作可参阅在线匡助。

2.神色网上填报肇始时间为2024年9月26日9:00。

四、评审款式

　　接管第一轮通信评审、第二轮碰头会评审款式。

五、立项公示

　　上海市科学本事委员会将按限定向社会公示拟立项神色清单，接受公众异议。

六、接洽电话

　　管事热线：8008205114（座机）、4008205114（手机）

本校安排：

请依托本校讲演的诚挚，于10月16日16：00前完成网上讲演并提交，过时后填报神色不赐与受理。

讨论东谈主：詹伟

讨论电话：55274272

邮箱：usstkjc@126.com

科技发展研究院

2024年9月19日